1、從屬不同

2、個頭不同

3、生長環境不同

4、肉質顏色不同

5、含鋅量不同

從屬不同：牡蠣的種類有很多，生蠔是其中的一種，可以說生蠔是牡蠣，卻不能說牡蠣是生蠔，兩者是從屬關系，是生蠔從屬于牡蠣。

個頭不同：生蠔的個頭較大，大生蠔加上可重量可以達到一斤多；而其他品種的牡蠣的個頭很小，有成人的一小節拇指那么大。

生長環境不同：生蠔一般生活在比較少見的江河和大海的交匯處，在半咸半淡的內灣淺海上，由于生長環境有所限制，所以產量很少；而牡蠣在我國自渤海、黃海至南沙群島均產，約有20種。

肉質顏色不同：生蠔的肉質是乳白色的；而有些品種的牡蠣肉質是淡青色的。

含鋅量不同：生蠔的含鋅量很高，每一百克的含鋅量為71.2毫克，比牡蠣高出了七八倍，被稱為“海里的牛奶”。