1、項目單位應當在貨物進出口前，填寫《進出口貨物征免稅申請表》，并持齊全有效單證向主管海關申請辦理進出口貨物減免稅審批手續。未在貨物進出口前向海關申請辦理減免稅審批手續，視作自動放棄其有關貨物的減免稅資格，海關應當不予辦理其有關貨物的減免稅手續。

2、海關在受理進出口貨物減免稅手續前，審核所提交單證是否齊全、有效，各項數據填報是否規范，項目資金來源是否影響減免稅貨物的所有權。

海關受理項目單位申請后，審核申請減免稅貨物是否符合國家稅收優惠政策規定，是否為不予免稅商品，是否在減免稅額度內，經審核無誤后予以簽發《征免稅證明》，除另有規定外，有效期不超過半年。

3、項目單位因故需變更已簽發的《征免稅證明》中可直接變更的欄目的，應當向主管海關提出書面申請，海關審核同意后予以變更；

因故需變更其他欄目或作廢已簽發的《征免稅證明》的，應向主管海關遞交書面申請，海關審核同意后予以變更或作廢，并收回作廢的《征免稅證明》。

項目單位不慎遺失已簽發的《征免稅證明》且需重新辦理的，應向主管海關遞交書面申請，海關審核同意并經核實《征免稅證明》的使用情況后，應及時將尚未使用的原《征免稅證明》的電子數據予以作廢，并重新簽發《征免稅證明》。