1、保稅物流園區(qū)與境外之間進出貨物報關

海關對園區(qū)和境外之間進出貨物，實行“備案制管理”，適用進出境備案清單。

(1)境外進入園區(qū)：不實行許可證件管理

(2)園區(qū)運往境外：從園區(qū)運往境外的貨物，免征出口關稅，不實行許可證件管理。

2、保稅物流園區(qū)與境內區(qū)外之間進出貨物報關

(1)園區(qū)貨物運往區(qū)外，視同進口。

※供區(qū)內行政管理機構及其經營主體和區(qū)內企業(yè)使用的機器、設備和辦公用品等需要運往區(qū)外進行檢測、維修的，應當向園區(qū)主管海關提出申請，經主管海關核準、登記后可以運往區(qū)外。并自運出之日起60天內運進區(qū)內。特殊情況不能如期運回，應當于期滿前10日內向主管海關申請延期，延長期限不得超過30天。

(2)區(qū)外貨物運入園區(qū)，視同出口。

※除已經流通性簡單加工的貨物外，區(qū)外進入園區(qū)的貨物，因質量、規(guī)格型號和合同不符等原因，應當在貨物申報進入園區(qū)之日起1年內向園區(qū)主管海關申請辦理退換手續(xù)。

(3)保稅物流園與其他特殊監(jiān)管區(qū)域、保稅監(jiān)管場所之間往來貨物。