中華人民共和國國家出入境檢驗檢疫局組建于1998年3月，系根據(jù)國務院機構改革方案，由原國家進出口商品檢驗局、原農(nóng)業(yè)部動植 物檢疫局和原衛(wèi)生部衛(wèi)生檢疫局合并組建而成，為副部級政府部門。2001年4月經(jīng)國務院決定國家質量技術監(jiān)督局與國家出入境檢驗檢疫局合并，組建中華人民共和國國家質量監(jiān)督檢驗檢疫總局（正部級，簡稱國家質檢總局）。 但出入境檢驗檢疫局作為相對獨立的機構其職能并沒有改變。

出入境檢驗檢疫局是主管出入境衛(wèi)生檢疫、動植物檢疫、商品檢驗、鑒定、認證和監(jiān)督管理的行政執(zhí)法機構，主要職責是：

（一）研究擬定有關出入境衛(wèi)生檢疫、動植物檢疫及進出口商品 檢驗法律、法規(guī)和政策規(guī)定的實施細則、辦法及工作規(guī)程，督促檢查 出入境檢驗檢疫機構貫徹執(zhí)行。

（二）組織實施出入境檢驗檢疫、鑒定和監(jiān)督管理；負責國家實 行進口許可制度的民用商品入境驗證管理；組織進出口商品檢驗檢疫 的前期監(jiān)督和后續(xù)管理。

（三）組織實施出入境衛(wèi)生檢疫、傳染病監(jiān)測和衛(wèi)生監(jiān)督；組織 實施出入境動植物檢疫和監(jiān)督管理；負責進出口食品衛(wèi)生、質量的檢 驗、監(jiān)督和管理工作。

（四）組織實施進出口商品法定檢驗；組織管理進出口商品鑒定 和外商投資財產(chǎn)鑒定；審查批準法定檢驗商品的免驗和組織辦理復驗。

（五）組織對進出口食品及其生產(chǎn)單位的衛(wèi)生注冊登記及對外注 冊管理；管理出入境檢驗檢疫標志、進口安全質量許可、出口質量許 可并負責監(jiān)督檢查；管理和組織實施與進出口有關的質量認證認可工 作。

（六）負責涉外檢驗檢疫和鑒定機構（含中外合資、合作的檢驗、 鑒定機構）的審核認可并依法進行監(jiān)督。

（七）負責商品普惠制原產(chǎn)地證和一般原產(chǎn)地證的簽證管理。

（八）負責管理出入境檢驗檢疫業(yè)務的統(tǒng)計工作和國外疫情的收 集和分析，提供信息指導和咨詢。

（九）擬定出入境檢驗檢疫科技發(fā)展規(guī)劃；組織有關科研和技術 引進工作；收集和提供檢驗檢疫技術情報。

（十）垂直管理出入境檢驗檢疫機構。

（十一）開展有關出入境檢驗檢疫方面的國際合作與技術交流， 按規(guī)定承擔技術性貿(mào)易壁壘和檢疫協(xié)議的實施工作，執(zhí)行有關協(xié)議。

（十二）承辦國務院及海關總署交辦的其他事項。