1、質量性狀的變異是呈間斷性，雜交后代可明確分組。數量性狀的變異則呈連續性，雜交后的分離世代不能明確分組。
2、質量性狀不易受環境條件的影響。數量性狀一般容易受環境條件的影響而發生變異，而這種變異一般是不能遺傳的。
3、質量性狀在不同環境條件下的表現較為穩定。而控制數量性狀的基因則在特定時空條件下表達，不同環境條件下基因表達的程度可能不同，因此數量性狀普遍存在著基因型與環境互作。
4、對于質量性狀一般采用系譜和概率分析的方法，并進行卡方檢驗；而數量性狀的研究則需要遺傳學方法和生物統計方法的結合，一般要采用適當的遺傳交配設計、合理的環境設計、適當的度量手段和有效的統計分析方法，估算出遺傳群體的均值、方差、協方差和相關系數等遺傳參數等加以研究