1、一方面要能夠起到區分會計科目的作用；另一方面，要便于會計人員的識別與計算機的輸入。科目編號能清楚地表示會計科目所屬的類別及其在類別中的位置。

2、一級會計科目的編號：一般采用四位純數字表示，其中：

第一位數字（即千位）：表示會計科目的類別，其中1表示資產類，2表示負債類，3表示所有者權益類，4表示成本類，5為損益類；

第二位數字（即百位）：可以劃分大類下面小類；剩余兩碼為流水號。為便于會計科目的增減，一般情況下，編碼要考慮到未來的擴展性，在編碼間，留有一定的間隔。

小類的排列順序也是有原則的，如：資產類下面的小類是按照變現能力大小排序；負債類下面的小類是按照流動性大小排序；所有者權益類下面的小類是按照轉化為資本的能力大小排序。

二級會計科目：一般采用六位編碼，其中前四位為一級科目的代碼，后兩位為流水號。如：銀行存款（編碼為1002）下根據銀行的不同，設置多個二級別科目，諸如“中國建設銀行”、“中國工商銀行”、“中國農業銀行”等等，則可分別編碼為：100201中國建設銀行、100202中國工商銀行、100203中國農業銀行。

一般情況下，二級科目都是根據企業的需要來設置。但無論一級科目、二級科目如何設置，其前提都必須要保證編碼的唯一性。因此，為了確保會計科目的唯一，數據保存時的檢驗動作必不可少。