1、雙重密碼保護，支付時需要支付寶密碼以及手機動態口令。

2、支付過程由支付寶CTU系統實時監控，所有異常交易都被重點關注。

3、開通快捷支付的商戶經過嚴格篩選，保證商戶資質。

4、大額交易回呼，如果用戶使用快捷支付進行了大額交易，會由支付寶客服通過電話與持卡人確認是否本人操作。

5、據支付寶客服中心介紹，如果用戶由于支付寶賬戶或銀行卡被盜，盜用者通過快捷支付造成了持卡人的資金損失，2013年4月，支付寶為持卡人贈送一份資金保障險，用戶今后使用快捷支付付款時如果發生被盜，平安產險將給予72小時內100%賠付，而投保費由支付寶承擔。

6、支付寶已通過PCI認證，Payment Card Industry（簡稱PCI）認證，是由VISA、美國運通公司、JCB和MasterCard等國際組織聯合推出，是目前全球最嚴格、級別最高的金融機具安全認證標準。