1、一方面，慈禧太后只有爭權奪利的野心，卻沒有強軍治國的本領。后宮干政在歷史上一直是大忌，之前光緒乖乖聽話做傀儡之時，自己垂簾聽政已經引起了諸多大臣不滿了。要是直接廢掉光緒皇帝之位，自己直接掌管朝政肯定是行不通。

2、另一方面，光緒曾在維新期間鼓勵報刊勇敢揭露時弊，當時的局勢報刊大都支持維新派，反對慈禧。罷黜消息一傳出來，一時間引發了大規模的抗議活動。

3、列強的反對，是慈禧不敢殺掉光緒的一個重要原因。當時的清政府外強中干，一切事務都由洋人說了算。罷黜光緒皇帝之位，列強顯然是不同意的。戊戌變法期間，西方各國都支持光緒。他們需要光緒皇帝建立一個更開明的政府來保障自己的利益。