福建福州自然保護區有兩個：

1、雄江黃楮林自然保護區，國家級(1985年建區)：

1.地處福建省閩清縣的西部，地理坐標北緯26°15′29″～26°22′41″、東經118°39′38″～118°51′19″，總面積12513.3hm2，其中：核心區面積4198.3hm2；緩沖區面積2224.9hm2；

2.保護區主要保護對象：以福建青岡林為代表中亞熱帶南緣基帶常綠闊葉林森林生態系統、溪流類濕地生態系統、珍稀瀕危野生動植物及棲息地、閩江水源涵養林。

2、福建長樂閩江河口國家濕地公園，國家級(2003年建區)：

1.位于福建省福州市長樂區潭頭、梅花鎮閩江入海口處，有河口水域、潮間帶沙灘、紅樹林沼澤等7種濕地類型，是候鳥遷徙重要越冬地、水鳥集中分布區、眾多珍稀瀕危鳥種的棲息地，多項指標達到國際重要濕地標準。

2.省、市林業部門專家、學者多年的研究調查結果顯示，閩江口濕地自然環境優越、生物多樣性豐富、稀有物種眾多，擁有動植物1084種，估計在此遷徙停歇的水鳥數量超過5萬只。在2013年“美麗中國·濕地行”活動中被評為“中國十大最美濕地”。