1、計算日期起始時間不同

2、保修期限不同

3、兩者遵循的法律依據不同

計算日期起始時間不同1、保修期的起算日期從業主工程師發給工程竣工證書之日算起；2、缺陷責任期從工程通過竣（交）工驗收之日起計算；由于發包人原因導致工程無法按規定期限進行竣（交）工驗收的，在承包人提交竣（交）工驗收報告90天后，工程自動進入缺陷責任期。

保修期限不同:1、保修國務院的《建筑工程質量管理條例》第四十條規定：“在正常使用條件下，建設工程的最低保修期限為：基礎設施工程、房屋建筑的地基基礎工程和主體結構工程，為設計文件規定的該工程的合理使用年限;（2）屋面防水工程、有防水要求的衛生間、房間和外墻面的防滲漏，為5年;（3）供熱與供冷系統，為2個采暖期、供冷期;（4）電氣管線、給排水管道、設備安裝和裝修工程，為2年。2、缺陷責任期一般有6個月，12個月或者24個月，具體由發承包雙方在合同管理中約定。

兩者遵循的法律依據不同:1、保修期遵循的是《建筑工程質量管理條例》；2、缺陷責任期遵循的是《建筑工程施工合同示范文本》.